No início, a Congregação foi chamada por Deus a trabalhar em prol do aperfeiçoamento de meninas e mulheres necessitadas de uma profunda renovação moral, o que foi recebido e que é conhecido como carisma da fundação.
O objetivo das Irmãs da Congregação das Irmãs de Nossa Senhora da Misericórdia não se limita apenas à busca de sua própria santificação através da prática das virtudes cristãs e dos conselhos evangélicos, mas também (…) ao trabalho de melhorar as jovens e mulheres caídas que desejam abandonar o caminho da iniquidade e retornar ao serviço de Deus. (…) O objetivo de evitar a queda não é realmente o foco de nossa Obra, (…) portanto, o número de jovens recebidas para fins de proteção deve ser sempre bastante limitado. Em nenhuma circunstância devem ser admitidas como pensionistas ou de qualquer outra forma semelhante a pessoas que não pretendem tornar-se irmãs ou penitentes. Assumir a liderança em casas de detenção e estabelecimentos correcionais seria contrário ao objetivo de nossa Obra e à independência, que são tão importantes para nossa instituição.
Constituições de 1909, art. 1.
No início de sua existência, a Congregação foi fundada com um propósito específico: realizar uma obra educativa junto a meninas e mulheres moralmente caídas (prostitutas) que desejavam, por sua própria vontade, mudar suas vidas. Isso é o que se conhece por “carisma da fundação”.
Ao longo da história da Congregação, esse carisma foi revelando seu desenvolvimento, e graças a ele a assistência pôde ser fornecida também a pessoas moralmente ameaçadas. Levando em consideração as condições sociais e a diminuição da idade de desmoralização, a Congregação expandiu seu escopo apostólico para incluir não apenas pessoas já corrompidas, mas também aquelas ameaçadas de degradação moral. Nas Constituições de 1930, foi escrito: Mulheres cujas condições de vida possam levá-las à perdição podem ser acolhidas nas casas da Congregação, com a ressalva de que seu número será sempre limitado.